Как рассчитать время на комфортную пересадку при перелете с детьми?

Если совсем впритык, то можно и без детей не успеть. Особенно с текущими задержками. Я бы брала часа 2,5 минимум, одну авиакомпанию и трансферный багаж. Но тут ещё от аэропорта зависит: одно дело пересадка даже во Внуково, а другое в новом аэропорту Стамбула.

Сколько летаем, пока никаких проблем не было, хотя первое время на купибилет подбирала рейсы с запасом в плане пересадки

Впритык можете не успеть по причине задержки первого самолёта. Также очень зависит, у вас единый рейс с пересадкой или 2 отдельных рейса (я летаю вторым вариантом).

Если разные авиакомпании на стыке, то вообще брать хороший запас. У меня подруга летела в прошлом голу из РФ в Европу через Стамбул, взяла 6 часов разницу, и опаздала, поэтому чио аэрофлот задержал вылет на 4 с лишним часа ( еще ковра тогда не было) и естественно, там ей ответили, что возмещать не будут цену за билет на улетевший самолет.

Зависит еще от аэропорта пересадки, если Стамбул новый или Бангкок, то впритык вы не успеете точно, нужен запас часа 3-4 хотя бы.